通过系统前端各种报警探测器发出非正常进入时的报警信号，在报警防区鸣响强声光报警信号。同时，将信号传送至安防监控中心，启动相关联动设备，完成摄像、打开灯光等其他工作。文溯阁《四库全书》藏书馆整体设置为局部三级纵深防护体系，设监视区、防护区和禁区三级防护体系。防护楼四周采用红外对射报警监视区，楼梯间采用双鉴探测报警、电视监控防护区，书库、监控室采用双鉴探测报警、电视监控和出入口控制现成禁区。楼梯间、出入口采用双鉴探测报警现成监视区，防护区、通道、楼梯间采用双鉴探测报警、电视监控现成防护区。另外，书库通道和8个防护区均设置声音复核装置，防护区内应安装防盗窗、防盗门并设置门禁控制器。
周界防范系统一般的周界防范报警系统是由探测器、报警控制器、联动控制器、模拟电子屏及探照灯、警笛等组成。根据现场地形地貌特点，馆区周边为复杂不规则曲边形状，设置馆区周界红外对射防范比较困难，所以采用局部红外对射防范报警系统―――安装红外对射探测器。
门禁控制系统以前的接触式门禁系统已慢慢被现在的拥有更多功能和优点的感应式门禁系统所取代。感应式门禁系统，可以有效地管理和限制进出的人员，对工作人员和非工作人员可以有效地进行进出权限的限定，并可以登记有关进出人员的情况，方便存档和日后需要时查询，这一方面提高了馆内库房的安全性，另一方面不仅减少了工作人员的数量，也使工作人员的工作量得到了很大的减轻。系统主要由门禁管理主机、系统软件、读卡器、电磁锁、射频卡组成。